En la paz de la República Mediatizada ocupó los cargos de Primer Gobernador de la Provincia de Pinar del Río y más tarde Subsecretario de Agricultura. Después de ocupar esos cargos durante los primeros años de la República Mediatizada, se retiró para Las Delicias dedicándose al cultivo del tabaco.
Aunque era el mayor enemigo que el Gobierno de Estrada Palma tenía en San Juan y Martínez no pensó alzarse contra él mismo, según sus palabras:
‘‘Tanto Sentimiento me ha dado la conducta del gobierno que ha llegado a considerarme extranjero en mi propia tierra y esto me obliga a no mezclarme con ninguna lucha política. ’’
Rodeado de sus familiares murió en San Juan y Martínez el 14 de febrero de 1916.
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